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如何快速的做生信分析

 九斗酒 2017-11-16

好多人想去做某一項分析,但是不知道有沒有現(xiàn)成的軟件可以做,或者有好多軟件,我不知道如何選擇哪一個軟件。只有解決這兩個問題,我么才可以迅速分析,得到想要的結(jié)果。

那么如何解決這個問題呢?小編主要推薦一個一個網(wǎng)站:

OMIC TOOLS:https:///

一、有沒有現(xiàn)成的軟件?

進入主頁,此網(wǎng)站列出了各種分析模塊:



然后選擇相應(yīng)的分析模塊,進入即可。此處我們選擇高通量測序這個模塊:HIGH-THROUGHPUT SEQUENCING。進入后顯示如下界面:



這個界面列出了此模塊分析內(nèi)容對應(yīng)的工具,直接進行查看即可。此處我們選擇RNA-seq analysis。進入后顯示如下界面,可以看到顯示RNA-seq分析的各項分析內(nèi)容,只需要點擊我們想要分析的即可,里面有眾多對應(yīng)的工具。



二、如何選擇工具?

以選擇Spliced read alignment 為例,進入后列出了各個軟件,部分軟件示例如下。每個軟件我們看到都有簡單介紹,對比一下各個軟件選擇即可


以Tophat為例進入,每個軟件我們看到都有簡單介紹,對比一下各個軟件即可。同時點擊左上方Tophat,直接進入下載頁面。

同時我們也要關(guān)注軟件發(fā)表的期刊,確定最佳軟件。

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