乳腺癌是全世界女性中最常見(jiàn)的癌癥,也是導(dǎo)致人類(lèi)死亡的第二大癌種。高發(fā)病率、高致死率的乳腺癌雖然可怕,但如果能夠做到及早發(fā)現(xiàn)、并按照最佳實(shí)踐進(jìn)行治療,則有望大大改善存活率。
目前,超聲等醫(yī)學(xué)影像是乳腺癌篩查和診斷的主要手段,在乳腺癌的評(píng)估中起著至關(guān)重要的作用。但由于醫(yī)療資源等問(wèn)題,全球約三分之二的人口仍無(wú)法獲得放射學(xué)診斷信息。
近年來(lái),隨著人工智能技術(shù)的發(fā)展,越來(lái)越多的人工智能算法應(yīng)用于醫(yī)學(xué)圖像領(lǐng)域,并深刻地改變了醫(yī)學(xué)影像的發(fā)展,從一開(kāi)始僅僅提供診斷信息,到引領(lǐng)個(gè)性化精準(zhǔn)醫(yī)療的實(shí)現(xiàn)。
在 6 月 21 日舉辦的 2020 北京智源大會(huì)開(kāi)幕上,智源研究院院長(zhǎng)黃鐵軍介紹到,清華大學(xué)、北京智源人工智能研究院、協(xié)和醫(yī)院和首都醫(yī)科大學(xué)的研究團(tuán)隊(duì)近日推出一項(xiàng)名為 SonoBreast 的研究成果,提出了一個(gè)經(jīng)過(guò)監(jiān)督學(xué)習(xí)預(yù)訓(xùn)練的、基于圖像塊的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分類(lèi)器,可以利用超聲波圖像進(jìn)行乳腺癌診斷篩查。
該工具包中包括一個(gè)惡性預(yù)測(cè)工具和一個(gè)分子亞型分析工具,可以進(jìn)行乳腺癌的分子分型以及惡性腫瘤識(shí)別。具體而言,該模型在乳腺癌分子分型的準(zhǔn)確率達(dá)到 56.3%,F(xiàn)1 Score 是 45.8%。
此研究項(xiàng)目由清華大學(xué)知識(shí)工程研究室(KEG)、北京智源人工智能研究院(BAAI)研究團(tuán)隊(duì)與北京協(xié)和醫(yī)院專(zhuān)業(yè)醫(yī)生共同開(kāi)發(fā),研究使用的數(shù)據(jù)集由北京協(xié)和醫(yī)院提供。目前,該AI篩查工具已經(jīng)上線。
學(xué)術(shù)君對(duì)該項(xiàng)目參與者、清華大學(xué)畢明杰(Alex)和張晨暉博士進(jìn)行了采訪,他們表示,SonoBreast 研究項(xiàng)目旨在開(kāi)發(fā)一種工具包,利用超聲波圖像進(jìn)行乳腺癌診斷篩查。借助 SonoBreast 惡性病變?cè)\斷系統(tǒng),,配合與之相適應(yīng)的硬件,力求實(shí)現(xiàn)在世界各地缺少熟練放射科醫(yī)生和超聲圖像檢查師的情況下進(jìn)行早期乳腺癌診斷。
另外,乳腺癌的治療方法會(huì)根據(jù)癌灶分子亞型的不同(Luminal A、Luminal B、HER-2陽(yáng)性和三陰性)而有著非常顯著的變化,因此,借助 SonoBreast 進(jìn)行乳腺癌分子亞型的分析,有望提高患者治療效果并減少有創(chuàng)活檢的次數(shù)。
乳腺癌阻擊戰(zhàn)
乳腺癌具有高并發(fā)率和高死亡率的特點(diǎn),嚴(yán)重威脅著全球女性的健康。
根據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)的報(bào)告,2018 年全球共有209 萬(wàn)乳腺癌病例,其中62.7萬(wàn)為死亡病例。乳腺癌已經(jīng)成為全世界女性最常見(jiàn)的惡性腫瘤以及第二大癌癥死因。
根據(jù)美國(guó)癌癥協(xié)會(huì)的數(shù)據(jù),1989 年至2016 年間,乳腺癌的死亡率已經(jīng)降低了40%。2007 年以來(lái),50 歲以下女性的死亡率并沒(méi)有顯著下降,但50 歲以上女性的死亡率仍在繼續(xù)下降。
這些進(jìn)展要?dú)w功于更好的治療方法以及乳腺癌的早期診斷。
其中乳腺癌的早期診斷來(lái)自人們意識(shí)的提高和新型的篩查技術(shù),而治療方案需要根據(jù)乳腺癌的分子分型確定。乳腺癌的分子分型分為 Luminal A 型,Lunimal B 型,HER-2 過(guò)表達(dá)型和三陰型四種。目前,乳腺癌的分子分型需要通過(guò)穿刺活檢來(lái)確定。但是,這種手術(shù)是侵入性的,具有一定風(fēng)險(xiǎn),并且可能存在假陰性。
乳腺癌常見(jiàn)的影像學(xué)診斷方法有乳腺攝影、超聲、磁共振成像、核醫(yī)學(xué)技術(shù)等,其中,超聲檢查的應(yīng)用最為廣泛,尤其在亞洲國(guó)家地區(qū)。與其他篩查技術(shù)相比,超聲檢查具有非電離輻射、無(wú)創(chuàng)性、高敏感性、便攜性、可及性和成本等優(yōu)勢(shì),當(dāng)然,超聲檢查由于噪聲和偽影的存在,其圖像質(zhì)量也往往較低。
近年來(lái),人工智能在醫(yī)學(xué)影像識(shí)別方面取得了巨大的進(jìn)步。在健康領(lǐng)域,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)具有非凡的能力,深度學(xué)習(xí)算法能夠識(shí)別醫(yī)學(xué)圖像的特征并學(xué)習(xí)如何對(duì)它們進(jìn)行分類(lèi)。
可以確定的是,為醫(yī)生提供輔助診斷的計(jì)算機(jī)系統(tǒng),將在醫(yī)學(xué)圖像識(shí)別領(lǐng)域扮演著重要的角色。這是因?yàn)?,重大疾病的篩檢,不僅是醫(yī)療護(hù)理的早期階段,甚至能夠?qū)崿F(xiàn)疾病的早期預(yù)防,而計(jì)算機(jī)輔助系統(tǒng)可以幫助醫(yī)生評(píng)估和發(fā)現(xiàn)異常的醫(yī)療圖像。 張晨暉博士在接受學(xué)術(shù)君采訪時(shí)表示,“乳腺癌分子分型對(duì)病人的臨床決策有重要意義。目前確定分子分型的方法只能通過(guò)穿刺活檢,該方法的缺點(diǎn)主要有:穿刺活檢具有創(chuàng)傷性;如果腫瘤的異質(zhì)性比較強(qiáng),活檢樣本不具有代表性;與超聲檢查相比,穿刺活檢的成本相對(duì)較高?!?/span>
“影像組學(xué)(Radiomics)是一種通過(guò)抽取大量醫(yī)學(xué)影像特征分析腫瘤基因分型的方法,具有安全無(wú)創(chuàng)的特點(diǎn),并且可以解決腫瘤異質(zhì)性難以采集的問(wèn)題。影像組學(xué)通常使用傳統(tǒng)的圖像特征提取方法,我們提出利用深度學(xué)習(xí)技術(shù)自動(dòng)提取和乳腺癌分子分型相關(guān)的影像特征,提高使用影像組學(xué)方法識(shí)別分子分型的準(zhǔn)確率。”輸入一張超聲圖像,輸出一個(gè)分子分型結(jié)果
在 SonoBreast 研究項(xiàng)目中,研究人員嘗試應(yīng)用機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)對(duì)乳腺癌的超聲圖像進(jìn)行分型。具體而言,研究人員創(chuàng)建了一個(gè)分類(lèi)器模型,以一組乳腺癌變的超聲圖像為輸入,輸出給定圖像的乳腺癌分子亞型的概率分布。
以為類(lèi)似的研究主要集中在乳腺病變的惡性腫瘤預(yù)測(cè)方面,研究人員認(rèn)為,放射科超聲提取的特征與乳腺癌分子亞型的類(lèi)型相關(guān),而乳腺癌分子亞型的診斷,對(duì)于疾病治療和預(yù)后都有主要意義,因此,該分類(lèi)器模型旨在重點(diǎn)實(shí)現(xiàn)通過(guò)乳腺癌病變的超聲圖像判斷乳腺癌的分子分型。
研究人員表示,SonoBreast 項(xiàng)目是他們和北京協(xié)和醫(yī)院超聲醫(yī)學(xué)科朱慶莉教授的團(tuán)隊(duì)一起合作的。 “在合作過(guò)程中,朱教授的團(tuán)隊(duì)提供了 1000 多例乳腺癌病例,包括 7000 多張乳腺癌超聲影像,并對(duì)分子分型進(jìn)行了標(biāo)注。我們主要負(fù)責(zé)模型的設(shè)計(jì)和實(shí)現(xiàn),并在朱教授團(tuán)隊(duì)提供的數(shù)據(jù)上訓(xùn)練和測(cè)試。我們和朱教授的團(tuán)隊(duì)共同分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果,討論改進(jìn)方向。其中朱教授團(tuán)隊(duì)根據(jù)他們?cè)诔晥D像處理、乳腺癌超聲診斷等方面的領(lǐng)域知識(shí)和經(jīng)驗(yàn),為我們提供了專(zhuān)業(yè)的建議。”
惡性預(yù)測(cè):該工具可預(yù)測(cè)乳房病變是惡性還是良性。對(duì)于患者病變的給定超聲圖像,提供病變的惡性診斷以及置信度(惡性概率)。
分子亞型:該工具可預(yù)測(cè)乳癌性病變的分子亞型。對(duì)于患者病變的一組給定的超聲圖像(至少一個(gè)圖像),將提供病變的預(yù)測(cè)分子亞型診斷以及置信度(每個(gè)亞型的概率)。該項(xiàng)目提出了一個(gè)經(jīng)過(guò)監(jiān)督學(xué)習(xí)預(yù)訓(xùn)練的,基于圖像塊的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分類(lèi)器。在訓(xùn)練過(guò)程中,模型采用期望最大化(Expectation Maximization, EM)方法選取用于訓(xùn)練的圖像塊。預(yù)測(cè)過(guò)程中,每個(gè)圖像塊的預(yù)測(cè)結(jié)果通過(guò)一個(gè)注意力網(wǎng)絡(luò)得到每個(gè)圖片的預(yù)測(cè);每個(gè)病例的預(yù)測(cè)結(jié)果進(jìn)一步由病例中所有圖片的預(yù)測(cè)結(jié)果通過(guò)整流網(wǎng)絡(luò)得到。整流網(wǎng)絡(luò)可以得到無(wú)偏的輸出,并且能夠調(diào)整先驗(yàn)概率。
目前,研究團(tuán)隊(duì)已經(jīng)發(fā)布了 web 應(yīng)用程序,允許病人和醫(yī)生使用該預(yù)測(cè)模型上傳超聲圖像。用戶可以上傳一定數(shù)量的超聲圖像,然后根據(jù)需要選擇超聲篩查部分,在提交圖像后,由模型計(jì)算預(yù)測(cè)結(jié)果,并用直方圖顯示模型圖的置信度。
畢明杰對(duì)學(xué)術(shù)君表示:“下一步我們計(jì)劃將部分乳腺超聲圖像數(shù)據(jù)公開(kāi),并可能以數(shù)據(jù)競(jìng)賽的形式讓更多人參與到 AI 輔助乳腺癌診斷的相關(guān)研究中。另外,我們正在嘗試收集更多的乳腺癌超聲影像,計(jì)劃采用自監(jiān)督學(xué)習(xí)的方法提高現(xiàn)有模型的準(zhǔn)確率。目前準(zhǔn)確率還不足以應(yīng)用于臨床實(shí)踐。我們會(huì)繼續(xù)提高識(shí)別精度,達(dá)到專(zhuān)家認(rèn)可的準(zhǔn)確率后再嘗試在醫(yī)院中臨床應(yīng)用。”
正如研究人員所說(shuō),人工智能的確是未來(lái)醫(yī)學(xué)的核心,借助交叉引用越來(lái)越多的數(shù)據(jù),輔助手術(shù)、遠(yuǎn)程患者監(jiān)控、智能假肢和個(gè)性化治療都將成為未來(lái)醫(yī)學(xué)的核心。
參考資料:
www.sonobreast.ai
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